版權的差異
  模板網站的版權是一個問題，因為他們大多來自于提供這個免費的源程序在互聯網上。版權無法保證，他們可能隨時被舉報或傳喚。
  可以擴展功能
  模板網站功能模塊是固定的，用戶不可以根據自己的需要進行修改，也就是說，他們不能去二次開發，無法實現自己想要的效果，只能在其中提供功能選擇，這是為自己的用戶。這樣就會大打折扣，許多常用功能都無法使用。一旦公司需要專業升級，通常需要完全重做。必須重新上傳和添加經過精心上傳的數據和數據，并且必須增加建站的成本。定制網站程序可以自己需求進行對網站各版塊功能進行修改。
  適應對象區別
  模版網站一般只適用于普通的企業展示站，對于有其它功能要求的用戶最好直接重新開發，因為在現有的模版程序上增加改動功能會比較麻煩。
  網站兼容性和搜索引擎友好性
  大多數模板網站使用table+CSS制作網頁。許多頁面代碼不符合國際W3C標準，不能與多個瀏覽器兼容。由于網站模板HTML代碼相同，對搜索引擎不是很友好。定制網站，使用div+CSS制作網頁。按照W3C國際標準，網站上線前通過了嚴格的內部測試，兼容多種瀏覽器，對搜索引擎更加友好，有利于網站在搜索引擎中的排名。
  安全系數不同
  模板網絡是一個現成的設計和程序。這個從網站上下載的開源程序，雖然構建網站的速度非常快，但這個開源程序的安全系數很低，存在很多漏洞，很容易讓黑客輕松破解網站，定制網站程序由全職程序員獨立開發。這個安全系數非常高，這也是全職公司必須具備的優勢之一。它擁有完整而安全的系統。